Xã Nam Du có địa giới hành chính bao gồm 10 đảo phía đông của quần đảo Nam Du, nằm ở phía đông nam đảo Phú Quốc trong vịnh Thái Lan, cách bờ biển Rạch Giá 65 hải lý. Các đảo nằm dưới sự quản lý hành chính của xã Nam Du: Hòn Bỏ Áo, Hòn Bờ Đập, Hòn Dầu, Hòn Đô Nai, Hòn Đụng Lớn, Hòn Đụng Nhỏ, Hòn Lò Lớn, Hòn Lò Nhỏ, Hòn Mấu, Hòn Ngang[3]. Trung tâm hành chính xã nằm trên đảo Hòn Ngang.

Xã có diện tích 4,4 km², dân số năm 2005 là 5.484 người[1], mật độ dân số đạt 1.246 người/km².